Épidémie : modéliser, prédire, communiquer

Ce cours plonge pendant une semaine les élèves dans l'univers de l'épidémiologie en leur demandant de jouer le rôle d'un comité d'experts en modélisation dans une organisation du type OMS ou Institut Pasteur. Lors de la première partie de la semaine, par groupes, ils doivent se constituer une expertise sur 4 maladies infectieuses, grâce principalement à des recherches documentaires ainsi que par une conférence/rencontre avec un épidémiologiste. Ensuite, ils implémentent des modèles de transmission de ces maladies et mettent en place les méthodes présentées durant les cours de la séquence thématique ou les premiers jours de la semaine (analyse de sensibilité globale, identifiabilité, estimation paramétrique, sélection de modèles). En 2ème partie de semaine débute la partie "challenge" dans laquelle les équipes sont en compétition pour traiter des données leur parvenant heure par heure comme dans une véritable situation de crise épidémiologique (vécue en accéléré !). Les équipes doivent se servir des modèles préalablement développés - et les adapter/améliorer - pour faire des prédictions de l'évolution de la situation, simuler des scénarios d'intervention et faire des recommandations. Ils doivent aussi prendre en compte les aspects liés à la communication de crise (rédaction d'un communiqué de presse et un rapport à l'intention des décideurs politiques avec l'aide d'une journaliste spécialisée en communication en situation de crise). La dernière demi-journée est consacrée aux restitutions et évaluations croisées et discussions sur différents les choix de modélisations effectués par les différentes équipes.
L'épidémiologie est un cadre qui se prête bien à cet exercice car c'est un domaine à fort enjeu, facilement accessible même pour des personnes ayant peu de connaissances en biologie, et dans lequel la modélisation mathématique joue un rôle prépondérant du fait de l'impossibilité de l'expérimental à l'échelle des populations.