Apprentissage profond pour l'imagerie médicale

Ref: 3MD3070

Description

Les technologies d'imagerie médicale fournissent des moyens inégalés pour étudier la structure et la fonction du corps humain in vivo. L'interprétation des images médicales est difficile en raison de la nécessité de prendre en compte des informations tridimensionnelles et variables dans le temps provenant de plusieurs types d'images médicales. L'intelligence artificielle (IA) est très prometteuse pour aider à l'interprétation, et l'imagerie médicale est l'un des domaines où l'IA devrait connaître les plus grands succès. Ces dernières années, les technologies d'apprentissage profond ont permis des avancées impressionnantes dans le traitement et l'interprétation des images médicales.


Ce cours couvre les aspects théoriques et pratiques de l'apprentissage profond pour l'imagerie médicale. Il couvre les principales tâches impliquées dans l'analyse d'images médicales (classification, segmentation, enregistrement, modèles génératifs...) pour lesquelles des techniques d'apprentissage profond de pointe sont présentées, aux côtés de certaines approches plus traditionnelles de traitement d'images et d'apprentissage automatique. Des exemples de différents types d'applications en imagerie médicale (cerveau, cardiaque...) seront également fournis.


Période(s) du cours

SM11

Prérequis

Il n'y a pas de prérequis officiel pour ce cours. Cependant, les étudiants sont censés avoir des connaissances en statistiques, en apprentissage profond de base et en programmation informatique.

Syllabus

  • Introduction à l'imagerie médicale

    Classification pour les données médicales

    Détection sur l'imagerie médicale

    Segmentation de l'imagerie médicale

    Validation, interprétation et reproductibilité

    Enregistrement des volumes médicaux

    Débruitage et reconstruction de l'imagerie médicale

    Modèles génératifs

Composition du cours

9 x 3h. En fonction du cours, soit 3h de cours, soit 1h30 de cours/ 1h30 de TP.

Pour les sessions pratiques (TPs), les étudiants doivent apporter leurs ordinateurs portables personnels.

Résultats de l'apprentissage couverts par le cours

Nous espérons qu'à la fin du cours, les étudiants pourront

aient une connaissance des techniques d'apprentissage profond les plus récentes pour l'imagerie médicale

auront une compréhension plus approfondie des méthodes d'apprentissage profond, applicables non seulement aux images médicales mais aussi à d'autres types de données

sauront comment construire et valider des modèles d'apprentissage profond pour les images médicales.

Support de cours, bibliographie

Datasets: Some of the public datasets for medical imaging can be found at:
  • https://github.com/beamandrew/medical-data
  • https://sites.google.com/site/aacruzr/image-datasets • https://github.com/sfikas/medical-imaging-datasets • https://grand-challenge.org/challenges/
Books:
  • I. Goodfellow, Y. Bengio, and A. Courville, “Deep Learning,” 2016.
  • Ch. Guy and D. Ffytche“An Introduction to the Principles of Medical Imaging”, 2005.
  • T. Hastie, R. Tibshirani and J. Friedman, “The Elements of Statistical Learning,” 2008.
  • Ch. M. Bishop,“Pattern Recognition and Machine Learning”, 2006
Related Conferences:
  • MICCAI (Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention)
  • IPMI (Information Processing in Medical Imaging)
  • ISBI (International Symposium on Biomedical Imaging)
  • MIDL (Medical Imaging with Deep Learning)